Zum zweiten Mal übernimmt Francisco Arce das Traineramt der paraguayischen Nationalmannschaft. Sein erstes Engagement an der Seitenlinie der Albirroja begann im August 2011 und endete im Juni 2012, nach einer Niederlage gegen Bolivien in der WM-Qualifikation für Brasilien 2014.

Im Anschluss daran war er in verschiedenen Vereinen in seiner Heimat als Trainer tätig. Unter anderem gewann er mit Cerro Porteño ungeschlagen die Meisterschaft. Arce war gerade als Trainer von Guaraní aktiv, bevor er erneut dem Ruf des Verbands folgte.

Als Spieler nahm der 45-Jährige an den FIFA Fussball-Weltmeisterschaften™ Frankreich 1998 und Korea/Japan 2002 teil und holte auf Vereinsebene unter anderem die Copa Libertadores 1995.